На базе лаборатории молекулярной диагностики с расширенной группой по экогенетике проводится изучение молекулярной эпидемиологии различных наследственных заболеваний  (туберозный склероз, наследственные опухолевые синдромы, ряд наследственных эндокринных заболеваний и т.д.). Научная работа лаборатории проводится в тесном сотрудничестве с кафедрой общей и молекулярной медицинской генетики СПбГПМУ, а также различными клиническими подразделениями СПбГПМУ.

 1. Изучение молекулярной эпидемиологии рецессивных наследственных заболеваний в России

Рецессивные наследственные болезни отличаются крайней степенью вариабельности частоты и структуры патогенных аллелей в различных популяциях. Для ряда наследственных болезней в России показан сильный «эффект основателя». Этот популяционно-генетический феномен приводит к тому, что большая часть случаев соответствующих синдромов оказывается связана с носительством одного или нескольких определенных патогенных аллелей из широчайшего спектра потенциально возможных. Вместе с тем, российская популяция остается недостаточно изученной в отношении множества генетических заболеваний. Нами сформирован перечень аллелей,  повышенная встречаемость которых характерна для Российской Федерации. Проводится изучение популяционной частоты founder-мутаций, ассоциированных с несиндромальной наследственной тугоухостью, пигментным ретинитом, нарушениями гемостаза, рецессивной эндокринной патологией, энцефалокардиомиопатиями и т.д.

  2. Изучение различных аспектов этиологии и патогенеза полипоза толстой кишки (семейный аденоматозный полипоз, MUTYH-ассоциированный полипоз, редкие разновидности полипоза)

 Генетически-детерминированный полипоз толстой кишки нередко выявляется в детском и подростковом возрасте. Эта крайне гетерогенная группа наследственных болезней является причиной развития приблизительно 1-1,5% случаев рака толстой кишки (РТК). Наиболее значимыми разновидностями полипоза являются семейный аденоматозный полипоз и MUTYH-ассоциированный полипоз (МАП). МАП отличается вариабельностью клинических проявлений, а также нехарактерным для наследственных опухолевых синдромов рецессивным типом наследования – это затрудняет клиническую диагностику данного заболевания. Вместе с тем, имеются сведения о своеобразных клинико-биологических особенностях опухолей, возникающих у пациентов с МАП. Эти особенности, возможно, могут повлиять на выбор оптимальной тактики лечения больных. В лаборатории проводится изучение молекулярной эпидемиологии генетически детерминированного полипоза толстой кишки у российских пациентов, поиск оптимальной стратегии выявления случаев МАП, изучение иммунологических и патоморфологических особенностей РТК, возникающего в контексте МАП.  

3. Изучение особенностей молекулярной эпидемиологии туберозного склероза.

Туберозный склероз (ТС) представляет собой аутосомно-доминантное заболевание, характеризующееся развитием доброкачественных опухолей (гамартом) различных органов, включая головной мозг, почки, сетчатку глаза, кожу и т.д. Усилия учёных из СПбГПМУ позволили  охарактеризовать спектр и структуру патогенных мутаций в генах TSC1 и TSC2 у российских пациентов и составить регистр больных туберозным склерозом (более 50 семей). Проводится поиск новых генов туберозного склероза. 

1.     Suspitsin E.N., Yanus G.A., Dorofeeva M.Yu., Ledashcheva T.A., Nikitina N.V., Buyanova G.V., Saifullina E.V., Sokolenko A.P., Imyanitov E.N. Pattern of TSC1 and TSC2 germline mutations in Russian patients with tuberous sclerosis // Journal of Human Genetics, 2018 (in press)

2.     Preobrazhenskaya E.V., Bizin I.V., Kuligina E.S., Shleykina A.Y., Suspitsin E.N., Zaytseva O.A., Anisimova E.I., Laptiev S.A., Gorodnova T.V., Belyaev A.M., Imyanitov E.N., Sokolenko A.P. Detection of BRCA1 gross rearrangements by droplet digital PCR // Breast Cancer Res Treat, 2017, Vol.165, P. 765–770.

3.     Sokolenko A.P., Savonevich E.L., Ivantsov A.O., Raskin G.A., Kuligina E.S., Gorodnova T.V., Preobrazhenskaya E.V., Kleshchov M.A., Tyurin V.I, Mukhina M.S., Kotiv K.B., Shulga A.V., Kuznetsov S.G., Berlev I.V., Imyanitov E.N. Rapid selection of BRCA1-proficient tumor cells during neoadjuvant therapy for ovarian cancer in BRCA1 mutation carriers // Cancer Letters, 2017, Vol. 397, P.127-132.